为了避免和减少牛、羊发生传染病、提高养殖效益，最好的预防措施就是每年春秋两季接种疫苗。疫苗接种可分为必须接种的，即常发、多发且危害较大的传染病；选择性接种的疫苗，是指该地区发生较少或即使发生危害性较小的传染病。而大型牛场、羊场应根据所在地疫情制定科学的免疫计划并按时接种，以确保牛羊健康。

牛接种疫苗

必须接种的：强制免疫的有口蹄疫疫苗和布氏杆菌菌苗，每年春、秋两季地方畜牧部门会登门进行接种。除此还应进行炭疽菌苗、多杀性巴氏杆菌灭活苗、沙门氏菌灭活苗、传染性胸膜肺炎（牛肺疫）疫苗的接种。其中炭疽菌苗可视当地发生本病情况而定，如果多年来当地没有该病的发生，当年雨水不大，又不是放牧牛，可以考虑不接种。

选择接种的：气肿疽菌苗、副结核灭活菌苗、狂犬病弱毒疫苗、破伤风类毒素。后者在去势或身体有外伤的应进行接种。其他疫苗应视当地传染病发生和流行情况而定。

羊接种疫苗

必须接种的：强制免疫的有口蹄疫疫苗、小反刍兽疫疫苗、布氏杆菌菌苗。如果有在强制免疫执行时遗漏的羊，养殖户也必须自己补免。此外还有山羊痘苗或绵羊痘苗，三联四防菌苗（快疫、猝狙、黑疫、肠毒血症）或相应的三联苗、五联苗，还有羊口疮弱毒疫苗和传染性胸膜肺炎疫苗都应及时接种。

选择接种的：母羊应接种羊衣原体灭活疫苗，个别地区还应考虑接种羊链球菌菌苗、羊大肠杆菌菌苗。有炭疽发生过的地区应考虑接种2号炭疽芽孢菌苗，妊娠母羊临产前应接种破伤风类毒素。